Череп
Игорь, Вы имеете в виду идею, а я - конкретную книгу!

Именно из-за того что они "попадали в жандармы", они выпадали из структуры вооруженных сил, и становились инородными. Плюс форма, которая подчеркивала что это не армия.
В условиях военной кастовости военная контразведка просто обязана быть в структуре ВС.
По поводу случая с Малиновским... Это вообще не задача военной контразведки.
Благонадежность,  политический сыск - отдельно.
Вопросы обеспечения секретности, противодествия военному шпионажу и диверсиям - отдельно.
Разделить эти функции, и "контрики" будут в армии вполне себе "своми", на уровне каких-нибудь "штабных".

Игорь Черепнев прав, ГГ мог с проявить инициативу о развитии контрразведовательных органов как в армии, таки территориальных.
" Русская военная контрразведка была оформлена в организованную структуру в 1903 г. Императором Николаем II. 20 января 1903 г. военный министр А.Н. Куропаткин направил на имя Государя докладную записку с обоснованием создания нового секретного подразделения военного ведомства. Военный министр полагал целесообразным создать в составе Главного штаба Военного министерства специальную структуру, которая специально занималась бы розыском иностранных шпионов и изменников по двум направлениям: руководящему и исполнительному. Руководящее направление предполагало вскрытие вероятных путей разведки иностранных государств, а исполнительное — непосредственное наблюдение за этими путями.
Деятельность сего органа должна заключаться в установлении негласного надзора за обыкновенными путями тайной военной разведки, имеющими исходной точкой иностранных военных агентов, конечными пунктами — лиц, состоящих на нашей государственной службе и занимающихся преступною деятельностью, и связующими звеньями между ними — иногда целый ряд агентов, посредников в передаче сведений...". Почитайте доступную литературу.ВЧК-ОГПУ-НКВД не на пустом месте организовались, практически все методы и приемы взяты у Особого корпуса жандармов.При этом большевики наводили критику на жандармов, армия,как и народные массы данную пропаганду поддержал. Кто-то славненько данные слухи культивировал (жандармы без чести и совести), в советское время эту тему с большим размахом в литературе, в кино  развили. До сих пор в армии можно услышать слова  "...жандарм появился" - это контрразведчик приехал на объект. Нужно сказать ,что некоторые сотрудники дают повод,чтобы говорили о данной службе нелицеприятные слова. о это издержки. Поддерживаю И.Черепнева и Д.Зуркова- по контрразведке.
Морская пехота уже была .Вот только привести в более  знакомый нам вид -это задача. Оружие,обмундирование,тактические и силовые приемы и прочее-работы непочатый край.

Бояться? В начале 20-го века?
Это как же они такого добьются?
Ну вот офицеры не подают руку жандармам, и разговаривают с ними через губу. И как в таких условиях добиться чтобы боялись? Начать расстрелы?
И как вообще работать в полку в таких условиях?