Любопытно... Итак, существуют (или существовали) жрицы, служащие Лилит. Это предполагает наличие определенного культа со своими ритуалами и обрядами. Судя по последним фразам, жрицы занимались отнюдь не молитвами в кельях. Возможно, какой-то орден наподобие тамплиеров? Завязанный на религии, но при этом состоящий из воинов (воительниц). Оружие - древние Евангелионы? И с кем же они тогда воевали? На чьей стороне?
Далее... Чем-то нападения Ангелов напоминают действия роботов, выполняющих определенную программу. Кстати, насколько я заметил, Ангелы первыми не атакуют? Ну так вот, складывается впечатление, что и Евангелионы, и Ангелы - это отголоски очень древней войны, в которой, похоже, победителей не было. Скажем, Ангелов запускает какая-то автоматическая база, согласно протоколу. Послали одного - не добрался. Послали второго, несколько измененного - не добрался. И так далее. Каждый новый Ангел - это совершенно другой вариант. Чем вызвана такая разница - вариантов масса. Либо нет четкой унификации таких биомашин, либо это попытки приспособиться... не знаю даже.
  В целом, по моему мнению, картина выглядит так: давным-давно была большая война. Кого  с кем - представить трудно. победителей не оказалось - погибли все. Где-то в космосе находятся остатки автоматической базы одной из сторон. Инциндент в Антарктиде стал своебразным "пусковым механизмом" для систем базы, и она начала посылать биомашины, названные Ангелами. Причем вовсе не с целью уничтожения людей - целью являются остатки вражеских баз. Может, в системе распознавания Ангелов людей вообще нет? И атакуют они по необходимости, постепенно пополняя базы данных.
  Единственно, тогда очень интересно, кто такой Каору? Версия биомашины для скрытого проникновения, изготовленная с использованием полученных данных?